La maladie serait apparue sur le continent il y au moins vingt mille ans, selon une étude de l'Institut Pasteur et du Centre national de recherche scientifique (CNRS) français, suite à une analyse sur le génome de quatre cent soixante-dix-neuf personnes originaires de treize populations d'Afrique subsaharienne.
Le paludisme est responsable de quatre cent trente-cinq mille morts chaque année. Quelque deux cents millions de cas ont été enregistrés en 2017 parmi lesquels deux cent soixante-six mille enfants de moins de 5 ans (deux cent dix-neuf millions dans le monde), selon l'Organisation mondiale de la santé (OMS). Parmi les pays les plus touchés sur le continent, figurent le Nigeria, Madagascar, la République démocratique du Congo (RDC) et l'Ouganda.
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